{"id":7283,"date":"2014-12-15T00:01:21","date_gmt":"2014-12-14T23:01:21","guid":{"rendered":"http:\/\/sciencetonnante.wordpress.com\/?p=7283"},"modified":"2014-12-15T00:01:21","modified_gmt":"2014-12-14T23:01:21","slug":"tous-les-oiseaux-du-monde-sur-un-seul-arbre","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/scienceetonnante.com\/blog\/2014\/12\/15\/tous-les-oiseaux-du-monde-sur-un-seul-arbre\/","title":{"rendered":"Tous les oiseaux du monde sur un seul arbre !"},"content":{"rendered":"<p><a href=\"https:\/\/scienceetonnante.com\/2014\/12\/sort_sol_pdfnet.jpg\"><img decoding=\"async\" class=\"alignleft size-medium wp-image-7290 lazyload\" data-src=\"https:\/\/scienceetonnante.com\/2014\/12\/sort_sol_pdfnet.jpg?w=300\" alt=\"Sort_sol_pdfnet\" width=\"300\" height=\"221\" src=\"data:image\/svg+xml;base64,PHN2ZyB3aWR0aD0iMSIgaGVpZ2h0PSIxIiB4bWxucz0iaHR0cDovL3d3dy53My5vcmcvMjAwMC9zdmciPjwvc3ZnPg==\" style=\"--smush-placeholder-width: 300px; --smush-placeholder-aspect-ratio: 300\/221;\" \/><\/a><span class=\"intro\">Il s&rsquo;agit de la plus grosse \u00e9tude scientifique jamais entreprise sur les oiseaux. Elle est le fruit d&rsquo;une collaboration entre pr\u00e8s de 80 laboratoires de recherche, qui ont r\u00e9alis\u00e9 le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome de 48 esp\u00e8ces d&rsquo;oiseaux, parmi les 10 000 que l&rsquo;on connait actuellement.<\/span><\/p>\n<p>Parmi les nombreux r\u00e9sultats de cette \u00e9tude (une vingtaine de publications au total), l&rsquo;une des plus importante concerne la reconstitution de l&rsquo;\u00e9quivalent de l&rsquo;arbre g\u00e9n\u00e9alogique des oiseaux. A partir des g\u00e9nomes et au prix de calculs ayant demand\u00e9 un total de 300 ans de processeur, il est en effet possible de pr\u00e9ciser les relations de parent\u00e9 entre les diff\u00e9rentes esp\u00e8ces, et m\u00eame de dater dans une certaine mesure les divergences entre les diff\u00e9rentes lign\u00e9es.<\/p>\n<p>Comme je suis sympa, je vous ai redessin\u00e9 l&rsquo;arbre \u00e0 partir de donn\u00e9es publi\u00e9es dans <em>Science<\/em> [1], vous pouvez cliquer pour le voir en plus grand.<!--more--><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/scienceetonnante.com\/2014\/12\/arbre-oiseaux.png\"><img decoding=\"async\" class=\"aligncenter size-large wp-image-7285 lazyload\" data-src=\"https:\/\/scienceetonnante.com\/2014\/12\/arbre-oiseaux.png?w=600\" alt=\"arbre oiseaux\" width=\"600\" height=\"800\" src=\"data:image\/svg+xml;base64,PHN2ZyB3aWR0aD0iMSIgaGVpZ2h0PSIxIiB4bWxucz0iaHR0cDovL3d3dy53My5vcmcvMjAwMC9zdmciPjwvc3ZnPg==\" style=\"--smush-placeholder-width: 600px; --smush-placeholder-aspect-ratio: 600\/800;\" \/><\/a><\/p>\n<p><em>(Petite pr\u00e9cision : dans cet arbre, je n&rsquo;ai not\u00e9 sur chaque branche qu&rsquo;un repr\u00e9sentant typique de chaque groupe, en g\u00e9n\u00e9ral l&rsquo;esp\u00e8ce s\u00e9quenc\u00e9e dans l&rsquo;\u00e9tude. Mais par exemple ici \u00ab\u00a0Moineau\u00a0\u00bb d\u00e9signe en fait le sous-ordre des Oscines, qui comprend \u00e0 lui seul pr\u00e8s de 4000 esp\u00e8ces dont le corbeau, l&rsquo;oiseau-lyre, etc.)<\/em><\/p>\n<p>Ce nouvel arbre apporte plusieurs enseignements remarquables, qui contredisent notamment certaines th\u00e9ories que l&rsquo;on a pu faire en se basant uniquement sur des crit\u00e8res morphologiques. On voit dans cet arbre que les autruches sont les oiseaux qui ont diverg\u00e9 le plus t\u00f4t des autres, ce qui est peu surprenant; mais aussi que les poules et autre canards sont aussi un groupe bien distinct. Plus amusant, on voit que <strong>le flamant rose est assez proche de la colombe et du pigeon<\/strong>, plus qu&rsquo;il ne l&rsquo;est par exemple du p\u00e9lican.<\/p>\n<p>Comme cet arbre permet de dater les divergences, on en apprend aussi beaucoup sur l&rsquo;histoire de l&rsquo;\u00e9volution des oiseaux. J&rsquo;ai d\u00e9j\u00e0 eu l&rsquo;occasion d&rsquo;en parler dans un billet, nous savions d\u00e9j\u00e0 que <a title=\"Pigeonraptor : les oiseaux sont des dinosaures\" href=\"https:\/\/scienceetonnante.com\/blog\/2012\/04\/02\/pigeonraptor-les-oiseaux-sont-des-dinosaures\/\">les oiseaux sont des descendants des dinosaures<\/a>. Mais on sait maintenant mieux comment les diff\u00e9rentes esp\u00e8ces se sont construites. En particulier l&rsquo;arbre ci-dessus r\u00e9v\u00e8le qu&rsquo;<strong>un \u00ab\u00a0big-bang\u00a0\u00bb de diversit\u00e9 s&rsquo;est produit juste apr\u00e8s la catastrophe qui fut \u00e0 l&rsquo;origine de l\u2019extinction des dinosaures<\/strong>, il y a environ 65 millions d&rsquo;ann\u00e9es. Vous pouvez voir sur l&rsquo;arbre que c&rsquo;est autour de cette p\u00e9riode que se produisent la majorit\u00e9 des diversifications. La quasi-totalit\u00e9 des groupes se sont constitu\u00e9s entre -65 et -50 millions d&rsquo;ann\u00e9es.<\/p>\n<p>Les r\u00e9sultats du consortium ont permis \u00e9galement de dater assez pr\u00e9cis\u00e9ment le moment o\u00f9 les oiseaux avaient perdu leurs dents dinosauriennes : vers 116 millions d&rsquo;ann\u00e9es. Enfin l&rsquo;arbre ci-dessus montre que l&rsquo;\u00e9mergence de la vocalisation chez les oiseaux avait eu lieu au moins deux fois de mani\u00e8re ind\u00e9pendante (chez tous les oiseaux situ\u00e9s en haut de l&rsquo;arbre, ainsi que chez le colibri), et que celle-ci fait intervenir des g\u00e8nes qui sont tr\u00e8s proches de ceux que l&rsquo;on retrouve chez l&rsquo;\u00eatre humain. Comme quoi \u00e9tudier les oiseaux pourrait peut-\u00eatre nous apprendre un peu sur notre propre langage !<\/p>\n<h4>Billets reli\u00e9s<\/h4>\n<p><a title=\"Pigeonraptor : les oiseaux sont des dinosaures\" href=\"https:\/\/scienceetonnante.com\/blog\/2012\/04\/02\/pigeonraptor-les-oiseaux-sont-des-dinosaures\/\">Pigeonraptor: les oiseaux sont des dinosaures<\/a><\/p>\n<h4>Cr\u00e9dits<\/h4>\n<ul>\n<li>Tommy Hansen. <a href=\"http:\/\/commons.wikimedia.org\/wiki\/File:Sort_sol_pdfnet.jpg\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">En st\u00e6refolk danner fascinerende formationer i luften over T\u00f8ndermarsken<\/a>. Wikimedia Commons<\/li>\n<li>Arbre phylog\u00e9n\u00e9tique : Science \u00e9tonnante, d&rsquo;apr\u00e8s [1]<\/li>\n<\/ul>\n<h4>R\u00e9f\u00e9rences<\/h4>\n<p>[1] E.D. Jarvis et al. \u00ab\u00a0Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds\u00a0\u00bb\u00a0Science 12 December 2014: Vol. 346 no. 6215 pp. 1320-1331<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Il s&rsquo;agit de la plus grosse \u00e9tude scientifique jamais entreprise sur les oiseaux. Elle est le fruit d&rsquo;une collaboration entre pr\u00e8s de 80 laboratoires de recherche, qui ont r\u00e9alis\u00e9 le s\u00e9quen\u00e7age du g\u00e9nome de 48 esp\u00e8ces d&rsquo;oiseaux, parmi les 10 000 que l&rsquo;on connait actuellement. 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